自體干細(xì)胞是來自同一患者的細(xì)胞，同種異體干細(xì)胞是捐贈的細(xì)胞（臍帶血、羊膜、胎盤或牙髓) 而不是來自患者自己。

對于大多數(shù)退行性疾病，自體細(xì)胞不如增強(qiáng)的同種異體細(xì)胞有效。來自脂肪組織和骨髓的細(xì)胞是優(yōu)勢，因為它們具有免疫特權(quán)，但同種異體間充質(zhì)細(xì)胞也可以逃避受體免疫系統(tǒng)，因為這些細(xì)胞不表達(dá)MHCII類受體并且表達(dá)非常低水平的I類MHC受體。

自體脂肪干細(xì)胞和內(nèi)皮祖細(xì)胞的問題在于它們很弱并且容易受到正常年齡和/或疾病相關(guān)變化的影響，并且在骨髓（產(chǎn)生它們的地方）中迅速減少。盡管我們能夠區(qū)分、培養(yǎng)和保存較舊的間充質(zhì)細(xì)胞，但與新鮮的同種異體細(xì)胞相比，它們通常要弱得多。

來自年輕患者的間充質(zhì)干細(xì)胞比來自老年患者的自體“脂肪”或骨髓細(xì)胞具有更大的再生能力。自體干細(xì)胞在不能使用同種異體“捐贈”細(xì)胞的美容干細(xì)胞治療中仍然發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。

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